Ниндзя Воин Тобикаге, рассказывает историю парня по имени Джо Майа. Однажды, Джо становится свидетелем битвы между пришельцами.Космические бомбардировщики с планеты Забум атакуют корабль принцессы с планеты Родарио, которая сбежала от императора Забума. Император злобно планирует захватить Вселенную, а пока он преследует принцессу, звездолет которой совершил аварийную посадку на Марсе. Джо пробирается на корабль принцессы, что влечет за собой цепь событий, полностью меняющих его жизнь...

375 год. Благодаря Рану и его самодельному компьютеру совместный план Эспер и империи провалился. В это же время группа хакеров объединяет в единую сеть разбросанные по всей галактике компьютеры и запускает на них ряд скрытых программ. Одна из них находится на компьютере Рана, из-за чего активируется предыдущий разрушительный план империи.

Братья-близнецы Тацуя и Кадзуя, а также их соседка Минами с самых ранних лет были вместе. Вместе играли, ели, принимали ванну… Обычные друзья детства… Прошло время и они подросли. Трудолюбивый Кадзуя стал любимцем всей округи, играя ведущую роль в школьной бейсбольной команде, тогда как безнадёжный лентяй Тацуя остался в тени славы брата, с чем легко смирился, несмотря на свои незаурядные способности. Однако с повзрослением ребята заметили, что рядом с ними есть и была одна очень прекрасная

2071 год, Дальний Восток, где идёт изнурительная война людей с неизвестной формой жизни — Клетками Оракула, которая словно чума распространилась по всему миру около двадцати лет назад и начала поглощать всё живое. Клетки Оракула могут принимать вид яростных Богов — Арагами — ужасных, кровожадных чудовищ, не знающих пощады и которых нельзя убить с помощью обычного оружия. Для борьбы с этими тварями была создана специальная организация «Фенрир». Её бойцы используют особый вид оружия, так

Год 2040. Уже прошло 30 лет с момента противостояния сил Земли и Зентреди, изменивших жизнь обеих рас. На планете Эдем в рамках сверхсекретного проекта «Супернова», целью которого является создание многоцелевого истребителя нового поколения, проходят сравнительные испытания двух прототипов истребителей-трансформеров - YF-19 компании Shinsei Industries и YF-21 от General Galaxy. По иронии судьбы тест-пилотами конкурирующих компаний становятся, бывшие когда-то друзьями, получеловек-полузентреди

2040 год, планета Эдем. Пилот-сорвиголова Исаму Дайсон переводится на испытания нового истребителя и сталкивается со старым соперником Галдом Боуманом - тот пилотирует в конкурирующем проекте. Появление их бывшей девушки Мюн распаляет давний конфликт. Тем временем на планете стартует долгожданный концерт виртуальной суперзвезды Шэрон Эппл.