Сплочённая группа из лучших друзей и членов семьи помогает Уэйду справиться с потерей его жены. Тем временем, занимаясь воспитанием двух дочек-подростков, он решается начать новую личную жизнь.

Леонардо, Рафаэль, Донателло и Микеланджело являются четырьмя черепахами-мутантами. Они отправляются на поиски приключений, где начинают использовать мистические силы ниндзя, которых они никогда не знали, учиться работать вместе и ориентироваться в опасности современной эпохи, чтобы стать командой героев.

Фильм основан на реальных событиях 1982 года о начале эпидемии крэка в Филадельфии и рассказывает историю отца и его усилиях, которые он прилагает чтобы защитить его дочь от коварной эпидемии, которая буквально вламывается в их дом через ее мать-наркоманку.

Доктор Джейкоб Худ - выдающийся биофизик и особый советник правительства по научным вопросам. Он расследует научные кризисы и загадочные феномены. Худ идет по следу каждого, кто использует научные открытия в собственных целях. Его страсть и миссия - защитить науку от нечестивых. Его зовут в последнюю минуту, и он - последний защитный рубеж.

Черепашки-ниндзя встречают незнакомца из будущего. Он прибыл, чтобы просить у них помощи в борьбе с ужасным инопланетным монстром. Леонардо, Рафаэль, Донателло и Микеланджело берутся за дело.